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无纸化微生物实验室的实现

发布时间:2015-10-19 浏览次数:340次

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位于英国Colindale的中心公共卫生实验室(CPHL)是英国医学微生物学国家级的基准实验室,而且是健康保护局(HPA)下属的专家及基准微生物部(SRMD)的一部分。CPHL承担着为区域实验室,NHS医院实验室,传染病防治顾问,社区和医院的医生,环境卫生人员,政府和行业顾问提供专业知识和建议的职责。

 最近为期两年的实验室信息管理系统(LIMS)实施工作在CPHL进入到最后阶段。该项目的主要目标是提供一个成套的即用型系统,结合部分定制开发,以满足CPHL实验室的需求。

 CPHL由五个部门、9个实验室组成。此前已经为四个实验室单独开发Oracle系统管理实验室的数据。其他的实验室有的运行自有的独立系统,或者完全没有使用任何信息化系统。因此,迫切需要一个集成的实验室信息系统以高效地采集和处理病人和样本的数据。系统还同时要考虑疾病暴发时的情况,以及与包括传染病监测中心(CDSC)在内HPA其他分部共享数据的需要。系统需要提供传染病在当地,区域,国家和国际的流行报告,统计数据和其他相关数据。管理信息还须提供关键绩效指标。

 英国的Sysmex公司承接下了该合同。由于CPHL的工作性质具有季节性变化的特点,因此决定在2年多的时间里分步实施,而不是选择一蹴而就的方法。

 实施

实施过程划分为五个阶段开展,在试点单位正式上线之前,大部分定制化的功能都已经完成。试点实验室为免疫接种和诊断部,属于肠道、呼吸道和神经病毒实验室(ERNVL),于2003年1月开始试运行。该单位每天处理100-150个样本。其他实验室的上线日期与每个实验室主任商定,并考虑当年所在的时间节点,资源的可用性和实验室的方便性。这样可以避免在实验室工作的繁忙时期实施系统从而给员工带来过多的压力。

 项目全程由一个稳定的项目小组进行LIMS的实施。每个实验室都至少派出一名代表担任项目成员。这些工作人员成为该信息化项目组与最终用户之间的沟通桥梁,同时他们对实验室的政策制度以及规程提出修改意见以最优化系统运行。项目团队的成员接受了LIMS“超级用户”的相关技术培训,使他们能够承担部分的实施工作和应对未来可能发生的变化,协助解答疑问,并提供内部培训。因此,CPHL可以培养出具有专业知识的内部人员来管理系统,而不是仅仅依赖于供应商。如今这个目的已经非常圆满地达到。现在每一个实验室都有一名实验室信息管理系统的“超级用户”,这些超级用户十分熟悉他们的实验室的参数设置。

 采用团队化的方法是项目成功的主要因素。还有的就是与最终用户的有效沟通,多领域意见征集的决策过程。用户接受度的被公认为最大的潜在障碍之一。对于那些已经使用原有的Oracle 系统10多年的用户来说,使用习惯的转变尤为具有挑战性。为了促进习惯的改变,实施过程中采用定期的团队会议,高频次的功能邮件通报,Demo演示和讨论会议,使得工作人员逐步适应新的变化。

CPHL很快就意识到有必要给项目组提供额外的资源以支持实施工作,包括用户培训、管理制度和IT的辅助支持。试点单位上线以后,培训讲师就开始培训所有其他最终用户,并建立了一个资讯台充当LIMS支持团队和用户之间沟通的桥梁。

现在CPHL的实验室已经有一个统一的LIMS系统(Sysmex MOLIS),并且加入了若干定制开发的应用。它已在CPHL的八个实验室得到应用,包括最后加入的性传播感染与细菌实验室(STBRL)。该项目实现的主要好处是:改善了应对工作请求的周转时间; 更好地记录疾病爆发数据; 优秀的样本跟踪; 提高了准确度; 和实时的统计整个CPHL的数据。

 无纸化的微生物实验室

该项目已经给实验室带来了业务流程上的改变。实验室接收的大量样品已经合理转移到到中心样本接收机构,每天大约800个样本(包括参考和监控)的接收采用无纸化的工作方式接收。

由于申请表在样本注册时就已经扫描入库,因此可在流程中的每一个节点上在屏幕上查看具体的申请信息。 系统一个主要的优点是,它允许根据各个实验室的具体需求采集更多的数据,如免疫接种日期和MMR监督工作的更多细节,旅行史,为肠胃炎测试的抗菌治疗。

 该系统可以帮助实验室工作人员执行日常任务,并帮助对微生物测试的不同步骤做出决定。每个单独的工作步骤,测试结果和用户信息详细地记录在电子表格中。这些结构化的和可搜索的工作表可以采用树形结构折叠和展开。在实施过程中,该小组已确定约230个不同类型的样本以及1100种测试选项。一个综合性医院类型微生物学部门使用MOLIS大约有200步。CPHL在微生物学工作区管理器(Microbiology Work Area Manager)中定义了3750个不同的步骤和15000个不同的结果代码。精心设计的逻辑编码简化搜索,数据输入过程中避免歧义。通过连接相对“沉默”的设备,这套新系统相比以前提供了更大程度的自动化。在性传播和血源性病毒实验室(SBVL),结果的自动下载特别节省时间。除了酶标仪接口,Sysmex也与CDSC监控系统Labbase2做了整合。

 由于CPHL监测和研究工作的性质,样品跟踪和存档成为建立LIMS的重要出发点。每个样本,分装单元和培养基都贴上了条形码,从登记入库到归档都可以跟踪。归档功能可以对放置在冰箱或培养库中的样品进行跟踪和定位以进行进一步的测试。CPHL各个层面广泛使用了MOLIS规则库和决策表,例如噬菌体类型衍化和样品路径。无纸化环境的其他功能还包括标准化的实验室报告生成,以及新开发的疾病爆发模块。

 CPHL变化频繁的工作性质和新测试方法的不断发展,客观上要求MOLIS能够快速修改和增加测试和代码而不影响日常工作或者损害历史数据。这在2003年SARS暴发时表现得尤为引人注目,当时需要在刚实施的ERNVL模块中快速添加一个全新的试验组。令人欣喜的是,包括测试项目,特定人群,结果代码,工作列表和样品路径等工作都是由CPHL的人员自行建立的,而非供应商Sysmex的工作人员。

 未来计划

从试点实验室的上线,到所有实验室在1月份全部上线,组织和员工之间建立了十分良好互信关系。项目按时完成并且没有超出预算,该项目被各方看作是一个巨大的成功。最初的合作方式已被证明是取得这一成果的关键因素。更高层次的信任也催生出一些额外的项目成果。